I
計算分子設計
- 電腦輔助藥物設計
- 人工智慧應用於藥物開發
臺大資工系 · 創立於 2006
計算分子設計與代謝體學實驗室
曾宇鳳教授 · 國立臺灣大學資訊工程學系
我們開發演算法與工具，用於鑑定並設計具特定用途的分子結構、在臨床代謝體學研究中偵測生物標記，並將同一套方法帶到環境化學與臨床評估。研究成果發表於國際期刊，也以公開工具與委辦系統的形式實際運作。
研究主軸
實驗室紀錄
本實驗室以計算方法研究分子與代謝物，開發演算法與軟體工具，並將其應用於藥物開發、環境與法規化學，以及臨床評估。創立時的兩大主軸為計算分子設計與代謝體學生物標記偵測，現已延伸為五個方向，另含量子計算、醫學影像計算與 AI Agent 系統。
方法工作橫跨藥物性質預測、環境分析與臨床評估：近年包括以可解釋的圖神經網路預測 P-醣蛋白受體、整理涵蓋大部分第一相藥物代謝的 CYP450 交互作用資料集，以及以深度學習加速全氟與多氟烷基物質的非目標鑑定。這些成果不只是論文：其中的資料集與工具本身就是產出。
本實驗室也承接委辦系統：自 2021 年 9 月起執行環境部化學署的 GreenN（SAS）高風險化學物質之安全替代化學物質搜尋、評估及篩選系統，協助企業評估化學品的危害、法規關注程度與可行替代方案，計畫持續進行中。在其架構上開發的「AI 綠色化學智匯診斷家」於 2025 年總統盃黑客松獲卓越團隊獎。
| 主持人 | 曾宇鳳 教授 |
|---|---|
| 所屬單位 | 臺大資工系 · 生醫電資所 · 基因體與系統生物學學程 · 智慧醫療學程 · 網媒所 |
| 公開工具 | cmdm.tw 網域下共 8 項服務 |
| 論文 | 2006 年起共 113 篇 |
| 歷屆成員 | 2008 年起共 97 人 |
| 成員 | 現役成員 38 人 |
最新消息
- 2025年曾宇鳳教授應長庚大學智慧運算學院暨人工智慧研究中心邀請演講題目「人工智慧在藥物發現與藥物開發的應用與前景」 [長庚大學]
- 2021年9月起實驗室承接「高風險化學物質之安全替代化學物質搜尋、評估及篩選系統」GreenN（SAS）計畫，由環境部化學物質管理署委辦，持續進行中 [GreenN (SAS)]
- 2018年曾宇鳳教授應生技中心(DCB)邀請演講題目「AI與機器學習對新藥開發臨床數據科學的影響」
- 2018年曾宇鳳教授應邀於台灣醫療科技展(DCB X AI)演講題目「AI for drug development: What's ready to go !」
- 2018年曾宇鳳教授應邀於高通量微通道化學合成技術研討會演講題目「Predictive Toxicology」
最新發表
Movement Anywhere: An Open-Source Distributed 2D Video-Based Movement Analysis Platform Empowered by Active Learning
出版社頁面 →A robust and interpretable graph neural network-based protocol for predicting p-glycoprotein substrates
出版社頁面 →Advantages of two quantum programming platforms in quantum computing and quantum chemistry
出版社頁面 →Altered gut microbial networks and metabolic pathways in multiple system atrophy: a comparative 16S rRNA study
出版社頁面 →獲獎紀錄
2026 年，曾宇鳳教授指導的師生團隊以「AI 綠色化學智匯診斷家」榮獲「臺大 1975 級電機系系友捐贈科技研究創新獎勵」特別獎，為該年度唯一特別獎。